Identification des staphylocoques et genres apparentés chez une marmotte américaine (Marmota monax) [Identification of staphyloccocus and related genera in woodchuck].

Résumé

L'identification de la microflore staphylococcique commensale de la marmotte a été l'objet de la présente thèse. Cette identification représente un interêt taxonomique mais également une base de données utilisable pour l'étude des dermatites de la marmotte américaine. Cette derniere est un modèle expérimental animal de l'hépatite b de l'homme. La microflore staphylococcique de la marmotte étudiée est composée de souches de Staphylococcus simulans (68%), Staphylococcus haemolyticus (24%), Staphylococcus lentus (4%), Staphylococcus aureux (2%) et quelques souches de Staphylococcus sciuri, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus warneri. Des souches de Macrococcus caseolyticus, jusqu'ici isolées uniquement chez les bovins, une baleine et dans les denrées alimentaires (Kloos et al. 1998) ont aussi été mises en évidence chez la marmotte. Ceci confirme par ailleurs la proximité des genres Macrococcus et Staphylococcus. La méthode employée a permis de sélectionner et de caractériser rapidement les souches appartenant au genre Staphylococcus et a ses genres apparentés phénotypiquement (Macrococcus et Stomatococcus). La combinaison du biotype (galerie ID32 Staph - bioMerieux) et du genotype (technique PCR-ITS 16s-23SrDNA, Polymerase Chain Reaction - Internal Transcribed Spacer) a permis une trés bonne identification des souches des différentes espèces et sous-espèces décrites, appartenant aux trois genres précités.